Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI15

Sphk1, Sphingosine kinase 1, mousemouse

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Length 382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sphk1Q8CI15 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Sphk1Q8CI15 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Sphk1Q8CI15 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Sphk1Q8CI15 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Sphk1Q8CI15 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Sphk1Q8CI15 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Sphk1Q8CI15 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Sphk1Q8CI15 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sphk1Q8CI15 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sphk1Q8CI15 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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