Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Hpf1Q8CFE2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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