Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc87Q8CDL9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc87Q8CDL9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms