Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCC3

Uncharacterized protein C12orf56 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CCC3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CCC3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CCC3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CCC3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CCC3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CCC3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms