Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7N7

Aph1b, Gamma-secretase subunit APH-1B, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1bQ8C7N7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Aph1bQ8C7N7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Aph1bQ8C7N7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Aph1bQ8C7N7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Aph1bQ8C7N7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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