Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Y0

4930572O03Rik, RIKEN cDNA 4930572O03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930572O03RikQ8C5Y0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
4930572O03RikQ8C5Y0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms