Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc113Q8C5T8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms