Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gpcpd1Q8C0L9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms