Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Olfr1189-201ENSMUST00000090700 921 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Trim35Q8C006 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Trim35Q8C006 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Trim35Q8C006 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Trim35Q8C006 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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