Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube3dQ8BX13 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube3dQ8BX13 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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