Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtpaQ8BWP5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtpaQ8BWP5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtpaQ8BWP5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
TtpaQ8BWP5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtpaQ8BWP5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
TtpaQ8BWP5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtpaQ8BWP5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtpaQ8BWP5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtpaQ8BWP5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtpaQ8BWP5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
TtpaQ8BWP5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtpaQ8BWP5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtpaQ8BWP5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtpaQ8BWP5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtpaQ8BWP5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtpaQ8BWP5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtpaQ8BWP5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtpaQ8BWP5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtpaQ8BWP5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtpaQ8BWP5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtpaQ8BWP5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtpaQ8BWP5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtpaQ8BWP5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtpaQ8BWP5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtpaQ8BWP5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtpaQ8BWP5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtpaQ8BWP5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtpaQ8BWP5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtpaQ8BWP5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtpaQ8BWP5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
TtpaQ8BWP5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TtpaQ8BWP5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms