Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gga3Q8BMI3 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms