Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rufy1Q8BIJ7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms