Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG73

Sh3bgrl2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl2Q8BG73 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Sh3bgrl2Q8BG73 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl2Q8BG73 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl2Q8BG73 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl2Q8BG73 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl2Q8BG73 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl2Q8BG73 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl2Q8BG73 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl2Q8BG73 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl2Q8BG73 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl2Q8BG73 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl2Q8BG73 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl2Q8BG73 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Sh3bgrl2Q8BG73 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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