Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpp38Q80UU2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms