Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
NischQ80TM9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NischQ80TM9 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
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