Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lamp3Q7TST5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lamp3Q7TST5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms