Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ClmQ7TSN2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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