Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Tnfsf18Q7TS55 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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