Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Actn1Q7TPR4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms