Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno2Q7TNB8 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms