Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc8Q7TN58 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc8Q7TN58 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.8 ms