Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Pcp4l1Q6W8Q3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcp4l1Q6W8Q3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms