Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Timd4Q6U7R4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Timd4Q6U7R4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Timd4Q6U7R4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms