Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt3Q6PE13 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms