Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN7

Hltf, Helicase-like transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HltfQ6PCN7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HltfQ6PCN7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms