Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Asic1Q6NXK8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Asic1Q6NXK8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms