Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg9bQ6EBV9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg9bQ6EBV9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms