Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scaf8Q6DID3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms