Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Pdzrn3Q69ZS0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Pdzrn3Q69ZS0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Pdzrn3Q69ZS0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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Pdzrn3Q69ZS0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Pdzrn3Q69ZS0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Pdzrn3Q69ZS0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Pdzrn3Q69ZS0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Pdzrn3Q69ZS0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
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Pdzrn3Q69ZS0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Pdzrn3Q69ZS0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdzrn3Q69ZS0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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Pdzrn3Q69ZS0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Pdzrn3Q69ZS0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Pdzrn3Q69ZS0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Pdzrn3Q69ZS0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzrn3Q69ZS0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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