Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spty2d1Q68FG3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms