Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CltcQ68FD5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CltcQ68FD5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms