Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Nlrp4fQ66X05 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4fQ66X05 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4fQ66X05 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4fQ66X05 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4fQ66X05 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4fQ66X05 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4fQ66X05 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4fQ66X05 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4fQ66X05 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4fQ66X05 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4fQ66X05 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4fQ66X05 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4fQ66X05 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4fQ66X05 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4fQ66X05 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4fQ66X05 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4fQ66X05 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4fQ66X05 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4fQ66X05 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4fQ66X05 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4fQ66X05 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4fQ66X05 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4fQ66X05 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4fQ66X05 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4fQ66X05 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4fQ66X05 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4fQ66X05 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4fQ66X05 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4fQ66X05 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4fQ66X05 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms