Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sf1Q64213 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sf1Q64213 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sf1Q64213 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Sf1Q64213 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf1Q64213 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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