Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Trim24Q64127 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Trim24Q64127 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Trim24Q64127 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Trim24Q64127 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Trim24Q64127 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim24Q64127 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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