Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pan3Q640Q5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pan3Q640Q5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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