Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SnrpcQ62241 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SnrpcQ62241 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SnrpcQ62241 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SnrpcQ62241 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SnrpcQ62241 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SnrpcQ62241 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SnrpcQ62241 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SnrpcQ62241 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SnrpcQ62241 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SnrpcQ62241 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SnrpcQ62241 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SnrpcQ62241 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SnrpcQ62241 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SnrpcQ62241 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SnrpcQ62241 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SnrpcQ62241 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SnrpcQ62241 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SnrpcQ62241 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SnrpcQ62241 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SnrpcQ62241 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SnrpcQ62241 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SnrpcQ62241 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SnrpcQ62241 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SnrpcQ62241 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SnrpcQ62241 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SnrpcQ62241 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SnrpcQ62241 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SnrpcQ62241 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SnrpcQ62241 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SnrpcQ62241 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SnrpcQ62241 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SnrpcQ62241 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SnrpcQ62241 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SnrpcQ62241 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SnrpcQ62241 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SnrpcQ62241 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms