Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctr9Q62018 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms