Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcd1Q61466 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcd1Q61466 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms