Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
JrkQ60976 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
JrkQ60976 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
JrkQ60976 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
JrkQ60976 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JrkQ60976 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
JrkQ60976 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
JrkQ60976 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
JrkQ60976 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
JrkQ60976 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
JrkQ60976 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
JrkQ60976 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
JrkQ60976 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms