Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grik1Q60934 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms