Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Neurod1Q60867 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Neurod1Q60867 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Neurod1Q60867 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Neurod1Q60867 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Neurod1Q60867 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms