Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms