Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CttnQ60598 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CttnQ60598 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CttnQ60598 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CttnQ60598 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CttnQ60598 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CttnQ60598 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CttnQ60598 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CttnQ60598 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CttnQ60598 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms