Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Tdrd5Q5VCS6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Tdrd5Q5VCS6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Tdrd5Q5VCS6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Tdrd5Q5VCS6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Tdrd5Q5VCS6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Tdrd5Q5VCS6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Tdrd5Q5VCS6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Tdrd5Q5VCS6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Tdrd5Q5VCS6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Tdrd5Q5VCS6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Tdrd5Q5VCS6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tdrd5Q5VCS6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms