Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

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Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Slc5a6Q5U4D8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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Slc5a6Q5U4D8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Slc5a6Q5U4D8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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