Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Rtp3Q5QGU6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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Rtp3Q5QGU6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rtp3Q5QGU6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rtp3Q5QGU6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rtp3Q5QGU6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rtp3Q5QGU6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rtp3Q5QGU6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rtp3Q5QGU6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rtp3Q5QGU6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rtp3Q5QGU6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rtp3Q5QGU6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rtp3Q5QGU6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rtp3Q5QGU6 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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