Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf3Q5HZG4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms