Protein–RNA interactions for Protein: Q4VBF2

R3hdm4, R3H domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm4Q4VBF2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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R3hdm4Q4VBF2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
R3hdm4Q4VBF2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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R3hdm4Q4VBF2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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