Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Defa20Q45VN2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Defa20Q45VN2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Defa20Q45VN2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Defa20Q45VN2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Defa20Q45VN2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Defa20Q45VN2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Defa20Q45VN2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Defa20Q45VN2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa20Q45VN2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Defa20Q45VN2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Defa20Q45VN2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Defa20Q45VN2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Defa20Q45VN2 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Defa20Q45VN2 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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